Kontrola rojalistów została teraz ograniczona do Cuzco na południowo-środkowych wyżynach. Wicekról rozpoczął kontrofensywę nad Ayacucho . To tam rozegrała się ostateczna bitwa o niepodległość Peru.

W dniu 9 grudnia 1824 r. Bitwa pod Ayacucho lub bitwa pod La Quinua miała miejsce w Pampa de La Quinua, kilka kilometrów od Ayacucho, w pobliżu miasta Quinua . Ta bitwa - między oddziałami rojalistów (hiszpańskich) i nacjonalistycznych ( republikańskich ) - przypieczętowała niepodległość Peru i Ameryki Południowej. Zwycięskimi siłami nacjonalistycznymi dowodził Antonio José de Sucre , porucznik Bolívara. Wicekról Serna został ranny i wzięty do niewoli. Armia hiszpańska miała 2000 zabitych i rannych oraz straciła 3000 jeńców, a pozostała część armii została całkowicie rozproszona. Po bitwie Serna podpisał ostateczną kapitulację, na mocy której Hiszpanie zgodzili się opuścić Peru. Serna został wkrótce potem zwolniony i popłynął do Europy.

Hiszpania podejmowała daremne próby zachowania swoich dawnych terytoriów, na przykład podczas oblężenia Callao (1826), ale po śmierci króla Hiszpanii Ferdynanda VII w 1836 r. rząd Hiszpanii zrzekł się roszczeń terytorialnych i suwerennych wobec całej Ameryki kontynentalnej. W 1867 roku Hiszpania podpisała traktat pokojowy z Peru, aw 1879 podpisała traktat uznający niepodległość Peru

Karol I, król Hiszpanii i Indii. Za jego panowania powstało Wicekrólestwo Peru.

Miasto Lima , założone przez Pizarra 18 stycznia 1535 roku jako "Ciudad de los Reyes" (Miasto Królów/ Mędrców ), stało się siedzibą nowego wicekrólestwa. Jako siedziba wicekróla, który sprawował nadzór nad całą hiszpańską Ameryką Południową, z wyjątkiem zdominowanej przez Portugalczyków Brazylii, Lima wyrosła na potężne miasto. W XVI, XVII i przez większą część XVIII wieku całe bogactwo kolonialne Ameryki Południowej stworzone przez kopalnie srebra przechodziło przez Limę w drodze do Przesmyku Panamskiego , a stamtąd do Sewilli, Hiszpania. Reszta wicekrólestwa była zależna od Limy w sprawach administracyjnych, zgodnie ze wzorem, który utrzymuje się do dziś w Peru. Na początku XVIII wieku Lima stała się wybitną i arystokratyczną stolicą kolonialną, siedzibą 250-letniego Królewskiego i Papieskiego Uniwersytetu San Marcos oraz główną hiszpańską twierdzą w obu Amerykach.

Na poziomie gruntu w pierwszym wieku hiszpańscy encomenderos byli zależni od lokalnych wodzów ( curacas ), aby uzyskać dostęp do daninowej siły roboczej ludności indyjskiej, nawet do najbardziej odległych osad, dlatego wielu encomenderos rozwinęło wzajemne, choć nadal hierarchiczne, relacje z curacas . ^[9] Pod koniec XVI wieku quasi-prywatna encomienda została zastąpiona systemem repartimiento (znanym w Peru pod nazwą keczua, mita ), kontrolowanym przez lokalnych urzędników koronnych.

Politycznie wicekrólestwo było dalej podzielone na audiencias , które były przede wszystkim trybunałami wyższymi, ale pełniły również funkcje administracyjne i ustawodawcze. Każdy z nich odpowiadał przed wicekrólem Peru w sprawach administracyjnych (choć nie sądowych). Audiencias dodatkowo włączyły starsze, mniejsze dywizje znane jako "gubernatorstwa" ( gobernaciones , z grubsza prowincje ) kierowane przez gubernatora. (Patrz, Adelantado .) Prowincje, które były zagrożone militarnie, zostały zgrupowane w generałów kapitanów , takich jak kapitan generalny Chile(założone w 1541 r. I ustanowione jako kapitan generalny Burbonów w 1789 r.), które były wspólnymi dowództwami wojskowymi i politycznymi z pewnym poziomem autonomii. (Wicekról był kapitanem generalnym prowincji pozostających bezpośrednio pod jego dowództwem).

Na poziomie lokalnym istniały setki dystryktów, zarówno na obszarach indyjskich, jak i hiszpańskich, na czele których stał corregidor ( znany również jako burmistrz alcalde ) lub cabildo (rada miejska), z których oba miały uprawnienia sądownicze i administracyjne. Pod koniec XVIII wieku dynastia Burbonów zaczęła wycofywać corregidores i wprowadzać Intendentów, których szerokie uprawnienia fiskalne ograniczały władzę wicekróli, gubernatorów i cabildos
Zobacz: Reformy Burbonów


Podziały Audiencia, Wicekrólestwa Peru c. ?1650, jak ponumerowano poniżej.

Gospodarka wicekrólestwa Peru w dużej mierze zależała od eksportu srebra . ^[13] Ogromne ilości srebra eksportowane z wicekrólestwa Peru i Meksyku głęboko dotknęły Europę, gdzie zdaniem niektórych uczonych spowodowały tzw. rewolucję cenową . ^[14] Wydobywanie srebra odbywało się przy użyciu robotników najemnych i najemnych, ^[15] jak również systemu pracy niewolnej mita , ^[14] systemu odziedziczonego z czasów przedhiszpańskich . Produkcja srebra osiągnęła szczyt w 1610 r. ^[14]

Po ustanowieniu wicekrólestwa Peru złoto i srebro z Andów wzbogaciło zdobywców, a wicekrólestwo stało się głównym źródłem hiszpańskiego bogactwa i władzy w Ameryce Południowej. Pierwsze monety wybite dla Peru (i rzeczywiście dla Ameryki Południowej) pojawiły się między 1568 a 1570 rokiem. Wicekról Manuel de Oms y de Santa Pau odesłał królowi ogromną sumę pieniędzy (1 600 000 pesos) na pokrycie części kosztów Wojna hiszpańskiej sukcesji . Było to możliwe po części dzięki odkryciu kopalń w Caraboya. Srebro z kopalni w Potosí w Boliwii krążyło po całym świecie. Srebro peruwiańskie i inne z Nowego Świata było tak obfite, że spowodowało inflację w Hiszpanii i załamanie jego ceny. Nawet dzisiaj Peru i Boliwia produkują większość światowego srebra.

Podczas gdy większość srebra z wicekrólestwa trafiła do Europy, część krążyła w Ameryce Południowej. Rzeczywiście, Real Situado było coroczną wypłatą srebra od wicekrólestwa na finansowanie stałej armii hiszpańskiej w Chile, która walczyła w przedłużającym się konflikcie znanym jako wojna z Arauco . ^[16] Z kolei Hiszpanie handlowali częścią tego srebra z Mapuczami , dając początek tradycji wyrobów ze srebra Mapuche . ^[17]

Kolejną kwestią obciążającą finanse wicekrólestwa było utrzymanie Valdivian Fort System zbudowanego w odpowiedzi na holenderską wyprawę do Valdivii w 1643 roku. ^[18]

Luis Jerónimo Fernández de Cabrera zakazał bezpośredniego handlu między Peru a Nową Hiszpanią (Meksyk) oraz prześladowania portugalskich Żydów, głównych handlarzy w Limie

Spis ludności przeprowadzony przez ostatniego Quipucamayoc wykazał, że Inków Peru zamieszkuje 12 milionów; 45 lat później, za wicekróla Toledo, dane ze spisu wyniosły zaledwie 1 100 000 Indian. Chociaż wyniszczenie nie było zorganizowaną próbą ludobójstwa , wyniki były podobne, w dużej mierze wynikające z ospy i innych chorób eurazjatyckich, na które tubylcy nie byli odporni. Miasta Inków otrzymały hiszpańskie chrześcijańskie imiona i zostały odbudowane jako miasta hiszpańskie, z których każde skupiało się wokół placu z kościołem lub katedrą naprzeciwko oficjalnej rezydencji. Kilka miast Inków, takich jak Cuzco, zachowało rodzime mury jako fundamenty swoich murów. Inne strony Inków, takie jak Huanuco Viejo, zostały porzucone dla miast położonych na niższych wysokościach, bardziej gościnnych dla Hiszpanów.

Wicekról José de Armendáriz przywrócił system, w którym szlachcice Inków, którzy mogli udowodnić swoje pochodzenie, byli uznawani za hijosdalgos Kastylii. Doprowadziło to do szaleństwa ze strony rdzennej szlachty, aby uzasadnić swój status.