Po wejściu na pokład pirackiego statku Lowther zaoferował marynarzom kufel rumu i dał im możliwość dołączenia do swojej pirackiej załogi. Mężczyzna o imieniu Charles Harris zgodził się i stał się jednym z najwybitniejszych piratów w grupie. W tym momencie wiadomo, że Lowther miał do dyspozycji wiele statków. Ostatecznie Harris otrzymał dowództwo nad jednym ze statków floty Lowthera i obaj kontynuowali wspólne pirackie działania. Jednak kiedy płynął swoją flotą przez Gwatemalę, został zaatakowany przez rdzennych Indian i zmuszony do porzucenia części załogi i statków. Całą pozostałą załogę i zaopatrzenie przeniesiono na statek zwany Revenge i w 1722 roku załoga popłynęła na odosobnioną wyspę La Blanquilla.

Wiadomo, że Lowther posiada jedną z niewielu kopii autentycznych Pirackich kodeksów , która przetrwała w Ogólnej historii piratów . Dzieli się tym egzemplarzem ze swoim partnerem Edwardem Lowem , który równie dobrze mógł być częścią jego floty podczas niektórych konfrontacji. Jego piracki kod wygląda następująco:

I. Kapitan ma mieć dwa pełne Udziały; [kwartalny] Mistrz ma mieć jeden Udział i połowę; Doktor, oficer, strzelec i bosman, jedna akcja i jedna czwarta.

II. Ten, kto zostanie uznany za winnego wzięcia na pokład Kapera jakiejkolwiek nielegalnej broni lub jakiejkolwiek innej zdobytej przez nas nagrody w celu uderzenia lub znęcania się nad sobą pod jakimkolwiek względem, poniesie taką karę, jaką zobaczą Kapitan i Większość Kompanii pasować.

III. Ten, kto w czasie starć zostanie uznany za winnego tchórzostwa, poniesie taką karę, jaką Kapitan i większość kompanii uznają za stosowną.

IV. Jeżeli na pokładzie jakiejkolwiek nagrody lub nagród zostanie znalezione złoto, klejnoty, srebro itp. o wartości ósemki, a znalazca nie dostarczy ich do Quarter Mastera w ciągu 24 godzin, poniesie on odpowiednią karę Kapitan i Większość Kompanii uznają to za stosowne.

V. Osoba uznana za winną gry lub wzajemnego oszukiwania na kwotę ryala plate, poniesie taką karę, jaką Kapitan i większość Kompanii uznają za stosowną.

VI. Ten, któremu zdarzy się nieszczęście stracić kończynę w czasie starcia, otrzyma sumę sześciuset części ośmiu i pozostanie na pokładzie tak długo, jak uzna to za stosowne.

VII. Dobre kwartały, które można otrzymać, gdy są pożądane.

VIII. Ten, kto pierwszy zobaczy Żagiel, będzie miał na jego pokładzie najlepszy pistolet lub broń strzelecką.

IX. Ten, kto będzie winny pijaństwa w czasie walki, poniesie taką karę, jaką Kapitan i większość kompanii uznają za stosowną.

X. Zakaz strzelania z broni w Hołdzie.

Ostateczny los

Gdy tylko mieli zacumować w porcie, Lowther i jego załoga zauważyli Brytyjski okręt wojenny o nazwie HMS Eagle
Lowtherowi udało się wydostać przez okno swojej kabiny i uciec do morza wraz z tuzinem członków załogi. Tylko czterem osobom udało się dotrzeć do brzegu po długiej i męczącej pływaniu, ponieważ większość piratów, jak na ironię, nie umiała pływać. Lowtherowi udało się przedostać na brzeg i stąd nikt tak naprawdę nie wie, co się z nim dalej działo. Po szeroko zakrojonych poszukiwaniach żołnierze twierdzili, że w końcu odnaleźli jego ciało.
Według relacji władz Lowther zdał sobie sprawę ze swojej sytuacji i zamiast dać się złapać do niewoli, strzelił sobie w głowę.